La diarrea en potros puede ser el resultado de una alimentación excesiva (p. ej., este tipo de diarrea ocurre cuando el potro se reúne con su madre, tras un periodo de separación) o inadecuada (p. ej., potros huérfanos alimentados con sustitutivos lácteos para terneros o sacarosa). En potros, la intolerancia a la lactosa es rara y puede determinarse mediante pruebas de tolerancia o por la respuesta clínica a la lactasa suplementaria. También se puede producir diarrea cuando los potros consumen sustancias indigestibles como fibra, arena, basura y piedras. La diarrea en potros se ha descrito asociada con infección por Strongyloides westeri, Parascaris equorum, y Cryptosporidium spp. (también ver Parásitos gastrointestinales de los caballos).